Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc87Q8CDL9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms