Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms