Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc169Q8BXX9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc169Q8BXX9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms