Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arfrp1Q8BXL7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfrp1Q8BXL7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms