Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps13cQ8BX70 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps13cQ8BX70 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps13cQ8BX70 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps13cQ8BX70 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps13cQ8BX70 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps13cQ8BX70 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps13cQ8BX70 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps13cQ8BX70 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps13cQ8BX70 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps13cQ8BX70 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps13cQ8BX70 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps13cQ8BX70 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms