Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Skor1Q8BX46 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms