Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP01

Vmac, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VmacQ8BP01 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VmacQ8BP01 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VmacQ8BP01 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VmacQ8BP01 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VmacQ8BP01 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VmacQ8BP01 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VmacQ8BP01 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VmacQ8BP01 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VmacQ8BP01 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VmacQ8BP01 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VmacQ8BP01 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VmacQ8BP01 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VmacQ8BP01 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms