Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130116L18RikQ8BMV6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms