Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zcchc4Q8BKW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms