Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dupd1Q8BK84 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dupd1Q8BK84 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms