Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rufy1Q8BIJ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms