Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fbxo28Q8BIG4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo28Q8BIG4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms