Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdca8Q8BHX3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdca8Q8BHX3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdca8Q8BHX3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms