Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Susd4Q8BH32 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Susd4Q8BH32 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms