Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vipas39Q8BGQ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Vipas39Q8BGQ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Vipas39Q8BGQ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Vipas39Q8BGQ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Vipas39Q8BGQ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Vipas39Q8BGQ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Vipas39Q8BGQ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Vipas39Q8BGQ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Vipas39Q8BGQ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Vipas39Q8BGQ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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