Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubash3bQ8BGG7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms