Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pknox2Q8BG99 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pknox2Q8BG99 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms