Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG22

Clca2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca2Q8BG22 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clca2Q8BG22 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Clca2Q8BG22 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Clca2Q8BG22 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms