Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Jmjd4Q8BFT6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Jmjd4Q8BFT6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Jmjd4Q8BFT6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms