Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Liat1Q810M6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Liat1Q810M6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Liat1Q810M6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms