Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stkld1Q80YS9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stkld1Q80YS9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stkld1Q80YS9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stkld1Q80YS9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stkld1Q80YS9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stkld1Q80YS9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stkld1Q80YS9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stkld1Q80YS9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stkld1Q80YS9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stkld1Q80YS9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms