Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh3b1Q80VQ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Aldh3b1Q80VQ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms