Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc155Q80VJ8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc155Q80VJ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms