Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Otop3Q80UF9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otop3Q80UF9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms