Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Avl9Q80U56 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Avl9Q80U56 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms