Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms