Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dsg1cQ7TSF0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dsg1cQ7TSF0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms