Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms