Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HhipQ7TN16 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HhipQ7TN16 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms