Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN05

Ap1s3, AP-1 complex subunit sigma-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s3Q7TN05 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ap1s3Q7TN05 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ap1s3Q7TN05 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms