Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Shq1Q7TMX5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Shq1Q7TMX5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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