Protein–RNA interactions for Protein: Q7M760

Zranb1, Ubiquitin thioesterase Zranb1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb1Q7M760 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb1Q7M760 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb1Q7M760 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb1Q7M760 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb1Q7M760 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb1Q7M760 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb1Q7M760 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb1Q7M760 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb1Q7M760 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zranb1Q7M760 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Zranb1Q7M760 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms