Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd2Q7JJ13 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Brd2Q7JJ13 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brd2Q7JJ13 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms