Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GypcQ78HU7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GypcQ78HU7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms