Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rph3alQ768S4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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