Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Syne2Q6ZWQ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Syne2Q6ZWQ0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms