Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Topbp1Q6ZQF0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Topbp1Q6ZQF0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Topbp1Q6ZQF0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Topbp1Q6ZQF0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms