Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smg5Q6ZPY2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms