Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kcnt1Q6ZPR4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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Kcnt1Q6ZPR4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Kcnt1Q6ZPR4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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Kcnt1Q6ZPR4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Kcnt1Q6ZPR4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kcnt1Q6ZPR4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms