Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcp4l1Q6W8Q3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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