Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt9Q6RHW0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt9Q6RHW0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt9Q6RHW0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt9Q6RHW0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt9Q6RHW0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt9Q6RHW0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt9Q6RHW0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt9Q6RHW0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt9Q6RHW0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt9Q6RHW0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt9Q6RHW0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt9Q6RHW0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms