Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx13Q6PHS6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snx13Q6PHS6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms