Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HjurpQ6PG16 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HjurpQ6PG16 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms