Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup98Q6PFD9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup98Q6PFD9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup98Q6PFD9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms