Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PdgfrlQ6PE55 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfrlQ6PE55 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms