Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trak1Q6PD31 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms