Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prkab2Q6PAM0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prkab2Q6PAM0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms