Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAC4

Uncharacterized protein C2orf71 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PAC4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q6PAC4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PAC4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PAC4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PAC4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PAC4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PAC4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PAC4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PAC4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q6PAC4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q6PAC4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PAC4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PAC4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6PAC4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6PAC4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms