Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atl2Q6PA06 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atl2Q6PA06 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atl2Q6PA06 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms