Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcf1Q6P542 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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